O uso do Contracep continuado por dois anos pode levar a mulher a não ter menstruação como o que está acontecendo com você; e o exame de Ecografia ou Ultrassonografia transvaginal revelou que você tem muitos cistos no ovário esquerdo. Só com esses dados não dá para fazer um diagnóstico. Qual o motivo de fazer o exame? Havia suspeita de alguma coisa? (gravidez, ovário policístico ou ...). Essa suspeita foi afastada ou comprovada?
A pílula do dia seguinte contem uma grande quantidade de hormônios e essa grande quantidade de hormônios podem levar a algumas alterações no corpo da mulher igual o que está acontecendo com você: Alteração na menstruação, vagina inchado seios sensíveis, náuseas. Pode haver outros motivos para isso acontecer, como uma infecção vaginal, porém no seu caso o mais provável é que seja decorrente da pílula mesmo.
Normalmente consideramos atraso menstrual para fins de suspeita de gravidez somente se esse atraso for superior a 15 dias, antes disso podem ocorrer atrasos eventuais que podem não significar uma gravidez.
Se sua menstruação é sempre certinha e existe a possibilidade de você estar grávida, qualquer atraso pode ser motivo para suspeitar.
O melhor exame nestes casos é o exame de sangue (Beta-hcg), mas espere completar pelo menos 15 dias de atraso.